Facebook Messenger dobio je neke nove funkcije koje se tiču end-to-end enkripcije razgovora. Za razliku od WhatsAppa, koji ima podrazumevanu end-to-end enkripciju za sve razgovore, u Messengeru korisnik mora posebno da ode u meni i otvori zaseban end-to-end enkriptovani čet.

Korisnici koji to čine će biti zadovoljni zbog nove promene u servisu, jer više nisu ograničeni samo na razgovore „jedan na jedan“. Sada je moguća i end-to-end enkripcija za grupne razgovore i pozive. Za poruke koje se same brišu i end-to-end enkriptovane razgovore, korisnik će dobiti i obaveštenje kada neko kreira skrinšot. Za ove razgovore su sada dostupni i GIF-ovi i stikeri, kao i reakcije, odgovaranje i indikatori za kucanje. U okviru enkriptovanih end-to-end razgovora pojavljivaće se bedževi za verifikovane naloge, a korisnik će moći da dugim pritiskom sačuva bilo koji video ili fotografiju koju primi, kao i da obradi video ili fotografiju pre slanja, prenosi GSM Arena.